Fernando Flores es profesor titular de Derecho Constitucional y miembro del Instituto de Derechos Humanos, de la Universitat de València. 

Diplomado en Derecho constitucional, Ciencia política y Relaciones internaciones por el Centro de Estudios Constitucionales de España. Diplomado en Altos Estudios de la Defensa, por el Centro Superior de Estudios de la Defensa Nacional (CESEDEN). 

En el ámbito universitario dirige su interés docente en investigador por los sistemas de protección de derechos fundamentales; los derechos de las personas mayores; seguridad y derechos; los partidos políticos y la democracia participativa y representativa. Es autor de varios libros y artículos académicos sobre estos temas. Codirige la Colección Cine y Derecho de la editorial Tirant lo Blanch.

En la Administración Pública ha trabajado como Director General de Análisis y Políticas Públicas de la Presidencia de la Generalitat Valenciana, y ha ocupado los cargos de Director General de Relaciones Institucionales del Ministerio de Defensa, Secretario General Técnico del Ministerio de la Presidencia, y Director de Gabinete del Secretario de Estado del Ministerio de Justicia, todos ellos del Gobierno de España.