Ignacio Flores Prada nació en Salamanca en 1966. Estudió Derecho en la Universidad de Sevilla entre los años 1984 y 1989. Inició su carrera académica en la Universidad Hispalense (Sevilla), incorporándose a la escuela de Derecho Procesal del Prof. Víctor Moreno Catena. Entre 1994 y 2002 fue profesor en la Universidad Carlos III de Madrid, en la que defendió su tesis doctoral sobre el Ministerio Fiscal en España. Desde 2002 es profesor en la Universidad Pablo de Olavide, donde en la actualidad es Catedrático de Derecho procesal.

Durante su formación académica pasó dos años en la Universidad italiana de Ferrara trabajando en su tesis doctoral bajo la dirección del profesor Massimo Nobili y un año en Roma como profesor investigador en el departamento de Derecho procesal penal de la Universidad Tor Vergata dirigido por Gustavo Pansini. Ha sido profesor invitado en las Universidades de París, Roma, Urbino, Florencia, Tegucigalpa y Autónoma de México, en las que impartió seminarios sobre la reforma del proceso penal, la prueba y el estatuto del Ministerio Fiscal en Europa. Ha sido vicedecano primero de la Facultad de Derecho de la Universidad Pablo de Olavide de Sevilla. Entre 2007 y 2013 dirigió el Máster Superior en Abogacía de la Universidad Pablo de Olavide. Forma parte del Consejo Científico del Instituto Alonso Martínez de Justicia y Litigación de la Universidad Carlos III de Madrid y de los claustros de postgrado internacional de las Universidades de Roma (Tor Vergata) y Florencia. Fue asesor del Ministerio de Justicia para la implantación del proceso digital y experto de la Conferencia de Ministros de Justicia Iberoamericanos para la reforma del proceso penal en Iberoamérica.

Es profesor del Máster en Criminología y Ciencias Forenses de la Universidad Pablo de Olavide, y del Máster Oficial en Abogacía de la misma Universidad. Participa en Consejos Editoriales de diversas revistas jurídicas españolas y extranjeras. Ha formado parte y dirigido varios grupos de investigación entre los que destacan los Proyectos Nacionales de Investigación sobre Prueba y nuevas tecnologías, Derecho de defensa penal: perspectiva nacional y europea, Protección procesal de los derechos y libertades de los ciudadanos y Garantías de los sujetos pasivos con trastorno mental en la justicia penal.

Entre sus publicaciones destacan:
- El valor probatorio de las declaraciones de los coimputados, Tecnos, Madrid, 1998.
- El Ministerio Fiscal en España, Tirant lo Blanch, Valencia, 1999.
- El proceso penal, (dirigida por Moreno Catena), 5 volúmenes, Tirant lo Blanch, Valencia, 1999 (edición).
- Los delitos en Internet, Ministerio de Sanidad y Consumo, Madrid, 2001.
- Manual de Organización Judicial (Moreno Catena dir.), Tirant lo Blanch, Valencia, 2002.
- El juicio rápido (con González Cano), Tirant lo Blanch, Valencia, 2004.
- La prueba pericial de parte en el proceso civil, Tirant lo Blanch, Valencia, 2005.
- La prueba anticipada en el proceso penal italiano, Tirant lo Blanch, Valencia, 2011.
- Criminalidad informática: aspectos sustantivos y procesales, Tirant lo Blanch Valencia, 2012.
- Derecho de defensa y Justicia Penal, Tirant lo Blanch, Valencia, 2014.
- Peligrosidad social predelictual y trastorno mental, Aranzadi, Pamplona, 2017
- Trastornos mentales y justicia penal, Aranzadi, Pamplona, 2018.
- Discapacidad y riesgo de los sujetos pasivos con trastorno mental en la justicia penal. Estudios sobre el Anteproyecto de Ley de Enjuiciamiento Criminal de 2020, Aranzadi, Pamplona, 2022.
- Valoración de la peligrosidad en la adopción de medidas cautelares y medidas de seguridad contra sujetos con trastorno mental en la justicia penal, Tirant lo Blanch, Valencia, 2024.